Laboratoire de virologie

Le laboratoire de virologie de l’Institut Pasteur de la Guyane (IPG) héberge 3 Centres Nationaux de Référence (CNR) respectivement pour les Arbovirus, les virus Influenzae et les Hantavirus pour le mandat 2012-2016. Nommés par le Ministère de la Santé pour des mandats de 5 ans, ces CNR ont pour mission, pour la région Antilles-Guyane et dans leur domaine d’expertise, d’assurer une surveillance virologique avec caractérisation des virus circulants, de contribuer à la surveillance épidémiologique, et d’apporter expertise et conseil aux autorités de santé. Le laboratoire de Virologie, de part ces activités de surveillance au niveau régional est à ce jour clairement identifié par les organismes régionaux, notamment l’Organisation Panaméricaine de la Santé (OPS).

Pour répondre à ces missions, le laboratoire de virologie dispose d’outils de diagnostic virologiques et sérologiques pour détecter un large éventail d’arbovirus d’intérêt médical pour la région dont les principaux appartiennent à la famille des Flaviviridae (dengue, fièvre jaune) et Togaviridae (virus tonate, mayaro ou chikungunya). Ces moyens diagnostiques ont, entre autres permis de mettre en évidence les épidémies de dengue survenues depuis ces 15 dernières années dans le département, de diagnostiquer en 1998 le premier cas de fièvre jaune en Guyane depuis 1902 et de détecter la présence du virus Mayaro en Guyane. Plus récemment, grâce à des travaux de recherche menés sur les hantavirus, virus émergent dans les Amériques, le laboratoire a pu mettre en évidence le premier cas humain d’infection autochtone et ainsi mettre en place des outils de diagnostic spécifiques pour leur identification. Parallèlement à ces activités de diagnostic et d’expertise au niveau régional, le laboratoire développe aussi des programmes de recherche en lien étroit avec ces missions. A ce titre, le laboratoire participe à la caractérisation sur le plan moléculaire des différentes souches de dengue et de grippe circulants dans les trois Départements Français d’Amériques (DAF) au travers de projets collaboratifs développés avec des partenaires régionaux et métropolitains. Il participe également à l’évaluation et/ou au développement de nouveaux outils diagnostiques. Ainsi, les travaux innovants portant sur la collecte de sang capillaire sur papier buvard ont permis de simplifier le diagnostic de la dengue chez des patients résidant dans les zones enclavées et territoires insulaires de la région, et ainsi de renforcer la surveillance des sérotypes de dengue circulants.

Enfin, le laboratoire de virologie, fort de l’expertise acquise sur les hantavirus, focalise ces efforts sur la mise en place de nouveaux outils de diagnostic visant à identifier d’autres virus à potentiel émergent ou réémergents à l’origine de syndromes viraux graves non étiquetés. En effet, dans le cadre du programme « STRonger » ciblé sur la thématique des maladies infectieuses émergentes en Guyane, le laboratoire mène un programme de recherche intitulé EMERGUY (EMERgences virales et syndromes sévères en GUYane) en collaboration avec le Centre Hospitalier de Cayenne (Service de Réanimation et Unité de Maladies Infectieuses et Tropicales du CHC). Ce projet devrait permettre le renforcement des outils de diagnostic du laboratoire et d’apporter des retombées significatives dans l’amélioration de la prise en charge des patients et des procédures de prévention et de contrôle de ces virus. Grâce au programme européen STRonger, le laboratoire de virologie dispose d’une équipe renforcée pour la mise en place de ce projet avec l’accueil d’une post-doctorante et d’une attachée de recherche clinique.